timeline Stories

• IrsiCaixa aïlla en els laboratoris de bioseguretat de nivell 3 de el Centre de Medicina Comparativa i Bioimatge (CMCiB) la variant Delta de la SARS-CoV-2 -descrita per primera vegada a l'Índia - per poder estudiar-la. El virus s'obté a partir d'una mostra de frotis nasal de pacients amb COVID-19. Un cop demostrat amb seqüenciació que la variant Delta és la causant de la infecció, l'equip investigador de el grup Patògens, Immunitat, Senyalització i Teràpies Aplicades (PISTA) d'IrsiCaixa, ha pogut aïllar el virus i fer-lo créixer en el laboratori. Aquest mateix procediment s'està fent amb una variant que es va detectar per primera vegada a Colòmbia, i que comença a ser freqüent a Catalunya. Aquesta variant, encara que no està en el grup de les variants preocupants (en anglès variants of concern), format per les variants delta, alfa, beta i gamma que ja hem aïllat i avaluat, sí que es considera una variant d'interès de la qual s'ha de fer un seguiment.
• El grup PISTA està fent un seguiment d'aquestes variants considerades preocupants i segueix avaluant com funcionen els antivirals contra aquests virus aïllats a partir de pacients al laboratori.
• s'han produït pseudo-virus de la variant Delta, És a dir, virus artificials amb la mateixa seqüència genètica que la variant detectada per primer cop a l'Índia. L'equip de el grup de Viología i Immunologia Cel·lular (VIC) ha pogut comprovar que aquests virus artificials contenen el mateix material genètic i que són infecciosos.
• Han provat la eficàcia dels anticossos biespecíficos que s'estan desenvolupant en el marc de l'consorci CBIG amb virus artificials i obtinguts de pacients de la variant Delta. D'aquesta manera han determinat que aquests anticossos sintètics que reconeixen dues regions diferents de virus segueixen sent funcionals davant la variant Delta, igual que amb la resta de variants considerades preocupants.
• Per poder fer estudis amb la variant Delta en models animals, Primer s'ha de caracteritzar la malaltia de COVID-19 amb aquest virus. Durant el mes de juny s'ha fet aquesta caracterització per poder tenir resultats veraços sobre l'efectivitat dels anticossos i vacunes contra aquestes variants.
  Durant aquest estudi s'observa que la variant Delta, a diferència de l'original, pot infectar ratolins que no contenen el receptor ACE2 humà, encarregat de capturar la SARS-CoV-2 en les cèl·lules pulmonars, fet que demostra un canvi en el rang de espècies que pot infectar el virus.
• Respecte a la vacuna contra la COVID-19, El consorci CBIG està generant canvis en els prototips de vacuna per tenir un ampli ventall de possibilitats. Al juny s'obtenen nous immunògens, és a dir, nous prototips, i es testen en models animals. D'altra banda, s'avalua l'eficàcia de la vacuna contra la nova variant Delta.

• Al voltant de el 8% de les persones que passen la COVID-19 no generen anticossos encara haver estat infectades per SARS-CoV-2. Per entendre com combaten el virus aquestes persones, IrsiCaixa ha comparat la resposta immunitària de les persones que superen la COVID-19 amb anticossos respecte la d'aquelles que no els generen. L'Institut ha pogut demostrar que, en aquest segon context, les cèl·lules T de sistema immunitari són molt eficaços, Ja que poques són suficients per evitar la severitat de la malaltia i, a més, són capaços de reconèixer proteïnes tant de l'exterior com de l'interior de l'virus. L'article, compartit en obert al dipòsit bioRxiv, identifica característiques de les cèl·lules T que ajudaran a detectar-les i fer un seguiment de la immunitat cel·lular contra la SARS-CoV-2. Els resultats destaquen l'elevada importància d'aquest tipus d'immunitat per a combatre la COVID-19 i, a més, serviran de guia per a incloure-la en el disseny de futures vacunes.
• Un bon control de la pandèmia passa per una revisió exhaustiva de la prevalença de les diferents variants de la SARS-CoV-2. Per aconseguir-ho, l'Institut d'Investigació de la Sida IrsiCaixa, ha creat una nova lloc web (http://covidtag.paseq.org/) que proporciona una visió detallada de com les variants de la SARS-CoV-2 van evolucionant en les diferents comunitats autònomes espanyoles. L'eina, anomenada CovidTag, accessible a el públic i permet obtenir el nombre total de mostres seqüenciades en cada regió. L'actualització setmanal de la informació és possible gràcies a la base de dades de GISAID, una plataforma que ofereix dades genòmiques globals relacionats amb la SARS-CoV-2.
• IrsiCaixa publica en BioRxiv un article que caracteritza la funció de dos tipus de cèl·lules de el sistema immunitari, anomenats macròfags i cèl·lules dendrítiques, en la infecció pel SARS-CoV-2. Aquestes cèl·lules tenen un receptor anomenat Siglec-1, que té un paper important en altres infeccions, com la de l'VIH o la Ebola. Per això, es volia avaluar quina funció tenia aquest receptor en el cas de la SARS-CoV-2. Els resultats han demostrat que en els macròfags Siglec-1 permet l'entrada de virus i desenvolupar una cascada de molècules inflamatòries, que en molts casos comporten una COVID-19 més severa. En el cas de les cèl·lules dendrítiques, el receptor permet capturar la SARS-CoV-2, emmagatzemar-dins de la cèl·lula i transportar-lo fins el pulmó, on hi ha les cèl·lules diana que un cop infectades causaran la COVID-19.

• Gràcies al finançament de #YoMeCorono, IrsiCaixa comença un estudi per entendre com es comporta la SARS-CoV-2 en dones embarassades que en el moment de donar a llum eren positives per COVID-19. Per a això, es van recollir mostres de diferents teixits de les voluntàries i es va avaluar la presència de virus. Entre aquests teixits hi ha el calostre, la placenta, la femta, entre d'altres.
• #YoMeCorono participa en projectes per poder trobar noves dianes que permetin atacar el virus. Una d'elles són els exosomes, compartiments envoltats per una membrana que circulen pel plasma i poden contenir parts de virus. Per això s'han analitzat plasmes de pacients amb COVID-19 per trobar exosomes i revelar quines parts de l'virus estan presents en aquests exosomes. A més, s'han posat a punt dos tecnologies per millorar el rendiment de l'aïllament de exosomes de l'plasma.

Després de la celebració d'una primera prova pilot a la Sala Apolo de Barcelona, ​​en la qual es va comprovar l'efectivitat de les mesures de cribratge i control amb tests d'antígens per evitar la transmissió de virus en entorns tancats amb gran afluència de persones, se celebra un segon estudi observacional en el concert de Palau Sant Jordi amb Love of Lesbian, amb més de 5.000 persones.

Després de comprovar que el SARS-CoV-2 no pot infectar les cèl·lules de el sistema immunitari que s'originen en la medul·la òssia, anomenades cèl·lules mieloides, IrsiCaixa està estudiant com s'activen aquestes cèl·lules que, en estadis avançats de la COVID-19, poden iniciar una resposta que empitjora la simptomatologia d'alguns pacients. A més, s'està investigant com responen aquestes cèl·lules del sistema immunitari enfront el SARS-CoV-2 en els estadis inicials de la infecció i si poden contribuir a la replicació viral.

Anàlisi de les dades de la immunitat de persones que van passar la COVID-19 fa un any per entendre quant dura la protecció contra el SARS-CoV-2. Els primers resultats apunten que no totes les persones que van passar la infecció per SARS-CoV-2 durant la primera onada mantenen els anticossos neutralitzants contra el virus, encara que la gran majoria dels que van passar per una hospitalització mantenen una resposta immunitària estable. D'altra banda, també s'ha estudiat quina és la protecció que tenen actualment aquestes persones davant les variants del virus detectades a Sud-àfrica i Brasil.

S'ha finalitzat la fase de reclutament de pacients de l'assaig clínic internacional INSIGHT-013-ITAC, que compta amb la participació de Roger Paredes. L'assaig busca determinar si afegir immunoglobulines hiperimmunes al tractament estàndard de la COVID-19 és beneficiós.

Validació definitiva d'un test ràpid d'antígens que ha mostrat molta especificitat i sensibilitat, comercialitzat per l'empresa Nesapor.

Inici de l'estudi de la resposta immunitària de persones amb un sistema immunitari debilitat que han rebut la vacuna. Aquest estudi inclou persones que han passat per un trasplantament de ronyó o de medul·la òssia i altres amb tumors sòlids. S'està duent a terme en col·laboració amb l'Hospital Clínic i l'Institut Català de Salut (ICO).

Creix el grup d'estudi de persones amb COVID-19 persistent. Les primeres investigacions suggereixen les afectacions en el nervi vague i les microafectaciones en el sistema cardiovascular com a possibles causes d'algunes malalties en pacients amb COVID-19 persistent. Es consolida la Unitat d'Covid Persistent en estreta col·laboració de la Fundació, IrsiCaixa i l'Hospital Universitari Germans Trias i Pujol.

 

Produir anticossos al laboratori és una eina potencial per proporcionar immunitat immediata a pacients amb COVID-19 però també a aquelles persones que la vacuna no hagi tingut l'efecte desitjat. IrsiCaixa està duent a terme un projecte, liderat per Julià Blanco, per desenvolupar aquests anticossos sintètics en el laboratori. Durant febrer, s'ha perfeccionat el seu disseny amb l'objectiu de millorar la seva producció i mantenir la seva activitat per bloquejar la SARS-CoV-2. Aquest nou prototip passa a ser la quarta generació d'anticossos. D'altra banda, s'observen bons resultats quan s'administren els anticossos sintètics dissenyats durant la primera generació per via intranasal, una opció que permetria utilitzar aquestes molècules com a profilaxi per la SARS-CoV-2.

IrsiCaixa està treballant en l'aïllament de les variants de la SARS-CoV-2 detectades a Anglaterra, Sud-àfrica i Brasil. Aquests virus permetran provar, al laboratori, l'eficàcia de fàrmacs antivirals.

El Can Ruti Sequencing Hub, un consorci format per IrsiCaixa, l'Hospital Germans Trias i Pujol, l'Institut d'Investigació Germans Trias i Pujol, ha sistematitzat el procés de seqüenciació de el genoma complet de la SARS-CoV-2 i seqüència 200 mostres a la setmana .

L'assaig clínic internacional ACTIV-3, que compta amb la participació de l'metge d'IrsiCaixa i FLS Roger Paredes, va confirmar que els anticossos monoclonals BRII, GSK i LY-CoV555 no afegeixen cap efecte beneficiós en el tractament estàndard dels pacients hospitalitzats.

Comencen els estudis amb els virus artificials dissenyats al laboratori i que contenen la partícula de l'espícula (proteïna S de espiga en anglès) amb les mateixes mutacions que la variant sud-africana i brasilera.

Segueix la identificació i caracterització de la immunitat cel·lular, una resposta protectora a llarg termini protagonitzada per les cèl·lules T de el sistema immunitari. En aquest projecte s'ha avaluat les respostes de les cèl·lules T en 13 individus que van passar una infecció moderada però que havien generat anticossos, un altre tipus de resposta immunitària més tardana a la cel·lular. Els resultats apunten que un 60% d'aquesta resposta va dirigida a la proteïna S (Pic) De l'virus. D'altra banda, també s'està estudiant com és aquesta resposta en les persones que, tot i haver passat la infecció per SARS-CoV-2, no han generat anticossos contra el virus. Per poder escalar l'avaluació de la resposta cel·lular a més individus, el grup Evasió Immunitària i Vacunes (VIRIEVAC) d'IrsiCaixa està desenvolupant un test per poder detectar aquest tipus de defenses i estudiar a quines proteïnes de virus van dirigides.

El virus muta per adquirir avantatges evolutius que poden comprometre els avenços científics en el camp de la COVID-19. És per això que IrsiCaixa incrementa els esforços de seqüenciació, una eina que permetrà controlar millor l'epidèmia, fer un seguiment de les variants i detectar l'aparició de noves mutacions.
Gràcies a les tècniques de seqüenciació, IrsiCaixa ha demostrat que un total de 11 mostres, Provinents de pacients de la comarca del Bages i amb sospita prèvia d'haver adquirit la soca britànica de la SARS-CoV-2, dins d'aquesta nova variant. S'implementa el Campus Can Ruti sequencing hub, Format per IrsiCaixa, els serveis de Microbiologia i Malalties Infeccioses de l'Hospital Germans Trias i Pujol i el servei de Genòmica Translacional de l'IGTP, que pretén seqüenciar 200 mostres de pacients amb COVID-19 a la setmana.

IrsiCaixa publica en obert els resultats d'un estudi en el qual avaluen 72 fàrmacs i confirmen que d'entre ells la Aplidina és el més potent bloquejant el virus, Fins i tot en comparació amb el Remdesivir, el fàrmac més àmpliament usat en la clínica actualment.

Publicació a la revista Med dels resultats de l'seguiment de la resposta immunitària de pacients que han passat la COVID-19 durant 6 mesos.

La cohort King arriba als 400 pacients reclutats i detecta el segon cas de reinfecció per SARS-CoV-2 que desenvolupa una clínica greu.

Els participants de la cohort CoronAvi @ s reben les vacunes aprovades per la Unió Europea i es comença el estudi de la seva resposta immunitària enfront de les vacunes. D'aquesta manera podrem entendre la capacitat de resposta d'aquest col·lectiu, que, a causa de l'edat, sol tenir menys capacitat de respondre adequadament a les vacunes, i així poder buscar solucions per millorar la seva protecció enfront de virus.

Es comença el estudi de la variant britànica de virus en el laboratori mitjançant pseudovirus, Virus artificials que contenen les mateixes mutacions que la variant de la SARS-CoV-2 circulant. L'objectiu és avaluar l'eficàcia dels anticossos naturals o produïts per vacunes enfront d'aquesta variant.

Es testen al laboratori els anticossos sintètics biespecíficos de tercera generació, Uns anticossos artificials que podrien unir-se a virus i impedir la seva entrada a les cèl·lules. Aquestes molècules mostren una capacitat per bloquejar la SARS-CoV-2 cent vegades més gran que les dissenyades en la primera generació.

Inici de l'assaig clínic per determinar l'eficàcia de l'CPC, Component químic present en els col·lutoris per reduir la capacitat de transmissió de virus en pacients.

Publicació de l'estudi sobre el risc de transmissió segons la càrrega viral de pacients amb COVID-19 a Catalunya. A major càrrega viral més gran és el risc de contagiar i també de progressar clínicament.

Estudiem l'especificitat i sensibilitat dels tests ràpids d'antigen per coronavirus de cinc marques diferents en comparació amb la tècnica de referència PCR i confirmem la seva utilitat com a eina de cribratge massiu.

Per entendre l'evolució de la pandèmia i valorar la possibilitat de revacunacions, és essencial estudiar quant dura la immunitat enfront de la SARS-CoV-2. IrsiCaixa demostra que els nivells d'anticossos neutralitzants, És a dir, amb efecte protector contra el virus, es mantenen al llarg dels sis mesos que ha durat l'estudi. No obstant això, un 40% dels pacients asimptomàtics tenen els nivells d'anticossos neutralitzants molt baixos, fet que qüestiona si estarien immunitzats davant d'una reinfecció.

IrsiCaixa, en col·laboració amb Dentaid Research Center, demostra que el clorur de cetilpiridini (CPC), component químic present en alguns col·lutoris, és capaç de reduir unes 1000 vegades la capacitat d'infecció de la SARS-CoV-2 en estudis duts a terme en cèl·lules al laboratori. A partir d'aquests resultats es planteja un assaig clínic per valorar la seva eficàcia en pacients, liderat per la Fundació Lluita contra la Sida i les malalties infeccioses (FLSida).

Portem a terme, juntament amb el grup Primavera Sound, el assaig clínic PrimaCoV, Per avaluar l'eficàcia de l'cribratge de casos positius per COVID-19 amb test ràpid d'antígens en un concert amb 500 persones.

Es dissenyen els anticossos sintètics biespecíficos de tercera generació per millorar la seva eficàcia i incloure la seva funció contra totes les variants conegudes de la SARS-CoV-2 i potencials variants que puguin emergir.

IrsiCaixa comença a treballar en les instal·lacions de el Centre de Medicina Comparativa i Bioimatge (CMCiB) amb virus SARS-CoV-2 obtinguts directament de pacients, una alternativa que substitueix als virus artificials àmpliament usats al laboratori. Aquest avanç logístic permet realitzar estudis molt més realistes i similars el procés d'infecció. Fins al moment, el treball amb "virus reals" es feia en els laboratoris de el Centre de Recerca en Salut Animal IRTA-CReSA, amb qui IrsiCaixa manté una estreta col·laboració.

Vam finalitzar la primera visita i el reclutament de la cohort CoronAvi i totes, un projecte que ha aconseguit comptar amb un total de 100 persones grans que viuen en residències i que han superat la COVID-19. el estudi de la resposta immunitària d'aquestes persones permetrà buscar solucions específiques per a aquest col·lectiu, que és el més afectat per la pandèmia.

Investigadors d'IrsiCaixa i l'Institut de Biologia Evolutiva (IBE) inicien un projecte amb organoides de pulmó i cervell, Miniórganos dissenyats al laboratori, que permetran simular una infecció pel SARS-CoV-2 el més real possible. L'objectiu d'el projecte és estudiar com aquest virus afecta els òrgans humans i la efectivitat de diversos fàrmacs per frenar la infecció.

Se aïllen els anticossos dels animals vacunats amb el prometedor disseny de vacuna de YoMeCorono per poder caracteritzar i l'efectivitat que tenen per bloquejar la SARS-CoV-2.

Iniciem l'estudi sobre l'eficàcia clínica i analítica de l'Test Ràpid de Diagnòstic de Antigen COVID-19 Panbio.

S'inicia un projecte per a veure els proteïnes cel·lulars són essencials per permetre o bloquejar la replicació de la SARS-CoV-2 i avaluar possibles fàrmacs dirigits a aquestes proteïnes. En col·laboració amb la Universitat Pompeu Fabra (UPF) es pretén identificar els factors de l'hoste essencials per al cicle d'infecció de la SARS-CoV-2. Un cop identificats, l'equip investigador pretén provar els fàrmacs que hi ha al mercat contra aquests factors per a la inhibició de la infecció viral.

S'han iniciat estudis sobre la funció de l'receptor ACE2 i la resposta immune innata en la infecció per SARS-COV2, el paper de la immunitat entrenada intervinguda per BCG i / o altres estímuls i l'avaluació de la patogènesi per SARS-Cov2 mitjançant models pre -clínics complexos a partir de teixits humans.

Inici de l'estudi CONVERTIR que testarà l'eficàcia de plasma de pacients convalescents per tractar la COVID-19 en pacients recentment infectats.

S'ha demostrat que el tractament amb altes dosis de immunoglobulines intravenoses (IVIG) redueix els nivells de citoquines que estan anormalment augmentats en els pacients COVID-19. També s'ha demostrat que les IVIG redueixen els nivells de proteïnes implicades en l'activació de el sistema immunitari a través del LPS (component majoritari de la membrana externa dels bacteris) i bloqueja l'activació de l'complement. Aquests resultats aporten important informació sobre el mecanisme d'acció de les IVIG en els pacients COVID-19.

S'estan analitzant les dades obtingudes de l' estudi CIRCUS l'objectiu és veure com afecta la càrrega viral inicial a el desenvolupament d'anticossos neutralitzants contra el virus.

L'equip de Julià Blanco ha deteminado els nivells d'anticossos neutralitzants contra la spike de la SARS-CoV-2 i les respostes cel·lulars a les proteïnes Spike i nucleoproteína.

desenvolupament de proves diagnòstiques per a mesurar la presència d'auto anticossos contra interferó alfa i omega, Així com en altres marcadors genòmics relacionats ara amb la immunitat adquirida.

Per determinar a quines parts de la SARS-CoV-2 van dirigits els anticossos neutralitzants -petites fletxes essencials per bloquejar el virus-, IrsiCaixa ha iniciat estudis per poder aïllar-los i caracteritzar-los. Per a això, s'utilitzen cèl·lules de persones que han passat la COVID-19 i han generat molts anticossos neutralitzants, en concret limfòcits B. Aquests anticossos aportaran important informació sobre els epítops neutralitzants (les regions en el virus contra els quals van dirigits els anticossos que bloquegen eficaçment el virus) i per tant dels mecanismes de protecció enfront de la infecció. Esperem poder utilitzar tota aquesta informació per millorar les vacunes contra la COVID-19.

En relació a la vacuna, durant aquest mes hem avançat en la producció i purificació de nous immunògens basats en modificacions de la proteïna S. Amb aquestes modificacions intentem millorar la capacitat d'aquestes proteïnes per generar anticossos neutralitzants protectors. Un cop purificats, hem començat a provar-los en models animals. Els primers resultats són molt prometedors. Esperem tancar aquests experiments a finals d'octubre / inicis de Novembre, quan sabrem si realment hem millorat la capacitat de produir anticossos neutralitzants amb aquests nous immunògens.

S'ha conclòs l'anàlisi de l'activitat antiviral enfront de SARS-CoV-2 en sistemes de cultiu cel·lular en el laboratori de 72 compostos aprovats per a ús en pacients i 28 possibles combinacions de fàrmacs. La nostra estratègia s'ha centrat en l'estudi de compostos aprovats per a l'ús clínic, ja que són els candidats ideals per avaluar en assaigs clínics amb pacients, cosa que ja s'està fent en la unitat de malalties infeccioses de l'Hospital Universitari Germans Trias i Pujol amb aquells compostos que hem prioritzat. Mentre que alguns fàrmacs com l'Aplidin són molt potents in vitro, altres antivirals usats en el camp de VIH com ara Truvada i Kaletra no tenen un efecte significatiu sobre el nou coronavirus.

S'ha acabat l'anàlisi d'una sèrie de casos de pacients hospitalitzats per COVID-19 que van ser tractats amb altes dosis d'immunoglobulines intravenoses per evitar que desenvolupessin una síndrome respiratori greu. Els primers cinc pacients tractats amb aquesta teràpia van reduir els seus marcadors d'inflamació, van millorar els seus nivells de limfòcits i van recuperar els nivells d'oxigen. No van requerir ingrés a la UCI i van ser donats d'alta precoçment.

S'ha posat a punt el model d'infecció de SARS-CoV-2 amb ratolí transgènic i hàmster i hem creat un model per poder testar la immunogenicitat en d'el porc.

S'ha demostrat que un gat de companyia d'un pacient afectat per l'covid-19 s'havia infectat a través del seu amo. Els gats poden infectar-se pel SARS-CoV-2 però no s'ha descrit fins ara que aquests animals puguin transmetre la malaltia a les persones.